Resekwencjonowanie Całego Genomu Roślin i Zwierząt (WGRS)

Opis usługi

Re-sekwencjonowanie całogenomowe (WGRS) polega na odczycie genomu roślin lub zwierząt i porównaniu go z sekwencją referencyjną. Pozwala to identyfikować warianty genetyczne (SNP, InDel, SV, CNV) oraz badać cechy istotne dla hodowli, biologii ewolucyjnej i ochrony środowiska. Dzięki technologii DNBSEQ™ oferujemy wysokiej jakości dane przy niskiej liczbie duplikatów i pełnej kontroli jakości.

1. Zakres usługi

• Sekwencjonowanie paired-end (100/150 bp)

• Przygotowanie bibliotek (PCR / PCR-free)

• Dostarczanie danych w formatach: FASTQ, BAM, Excel

• Analiza standardowa i spersonalizowana (m.in. SNP, InDel, CNV, GWAS)

• Czas realizacji: 15–30 dni roboczych (dostępny tryb ekspresowy)

• Jakość danych: Q20 ≥ 85%

• Rekomendowane pokrycie:

  • 10–30X – badania indywidualne

  • 5–10X – badania populacyjne

2. Etapy realizacji

1. Kontrola jakości próbki

2. Budowa biblioteki DNA

3. Sekwencjonowanie (DNBSEQ™)

4. Uzyskanie i filtrowanie surowych danych

5. Analiza bioinformatyczna (warianty, populacje, GWAS)

6. Raportowanie wyników i wizualizacja

3. Bioinformatyka

• Filtrowanie i dopasowanie odczytów

• Identyfikacja SNP, InDel, SV, CNV

• Anotacja i wizualizacja (diagramy kołowe, zestawienia)

• Analiza genetyczna populacji

• Analiza GWAS (Genome-Wide Association Study)

4. Wymagania dotyczące próbki