Menu
- Laboratorium
- Pobór prób
- Diagnostyka
- Weterynaria
- Next Generation Sequencing
- Whole Genome Sequencing
- Whole Exome Sequencing
- Whole Genome Bisulfite Sequencing
- Whole-genome Resequencing (WGRS)
- Metagenomic Sequencing
- RNA Sequencing for Cancer Research
- RNA-Seq (Transcriptome)
- Small RNA Sequencing (with UMI)
- Single-cell high-throughput RNA sequencing (scRNA-seq)
- Spatial transcriptome-Stereo-seq
- 16S/18S/ITS Sequencing
- Pre-made Library Sequencing
- Long noncoding RNA (lncRNA) Sequencing
- Spektrometria mas (MS)
- Technologie wodorowe
- Testowanie żywności
- Używany sprzęt laboratoryjny
- Allegro Aukcje
- Oligonukleotydy
- Synteza peptydów
- Zdrowie
- Nowości
- Promocje
Producenci
Sekwencjonowanie amplikonów 16S / 18S / ITS
Opis usługi
Sekwencjonowanie regionów 16S, 18S oraz ITS pozwala na dokładną identyfikację bakterii, grzybów i archeonów w próbkach środowiskowych. Usługa ta umożliwia analizę mikrobiomu bez konieczności izolacji i hodowli, wykorzystując technologię DNBSEQ™ do uzyskania danych o wysokiej rozdzielczości i jakości.
Nie znaleziono produktów spełniających podane kryteria.
1. Zakres usługi
-
Amplifikacja regionów 16S / 18S / ITS za pomocą PCR
-
Sekwencjonowanie paired-end (PE300) – długie odczyty
-
Generowanie surowych danych i analiza bioinformatyczna
-
Standardowe formaty wyników: FASTQ, Excel, PNG
-
Możliwość dostosowania pipeline’u bioinformatycznego
-
Przechowywanie danych dostępne na życzenie
-
Czas realizacji: 35 dni roboczych (dostępna wersja ekspresowa)
2. Etapy realizacji
-
Kontrola jakości próbki DNA
-
Amplifikacja i przygotowanie biblioteki
-
Sekwencjonowanie PE300 (DNBSEQ)
-
Uzyskanie i filtracja danych
-
Bioinformatyczna klasyfikacja i raportowanie
3. Bioinformatyka
Standardowa analiza:
-
Filtrowanie i składanie sparowanych odczytów
-
Grupowanie odczytów w OTU (Operational Taxonomic Units)
-
Klasyfikacja taksonomiczna
-
Histogram profilu gatunkowego
-
Mapa cieplna, drzewo filogenetyczne
-
Indeksy różnorodności alfa i beta
-
PCA, krzywa rangi, analiza porównawcza między próbkami
Opcje zaawansowane:
-
Niestandardowa adnotacja
-
Dostosowanie formatu wyników
-
Analizy porównawcze wielu środowisk
4. Wymagania dotyczące próbki
-
Rodzaj materiału: nienaruszone DNA genomowe
-
Ilość DNA: ≥50 ng (zalecane)
-
Stężenie: brak sztywnych progów, ale zalecane > 0 ng/µL
-
Czystość: brak zanieczyszczeń białkowych lub RNA
-
Bez fragmentacji – analiza nie dotyczy DNA degradowanego
5. Dlaczego warto?
-
Identyfikacja mikroorganizmów trudnych do hodowli
-
Technologia PE300 umożliwiająca wysoką dokładność
-
Sprawdzone protokoły i kontrola jakości na każdym etapie
-
Elastyczna analiza dopasowana do rodzaju próbek i środowiska
-
Zastosowanie w badaniach środowiskowych, biologii gleby, medycynie, mikrobiologii przemysłowej
Kontakt
Zamów usługę lub skonsultuj projekt:
✉ gene@relvo.pl