Całogenomowe Sekwencjonowanie Bisulfidowe (WGBS)

Opis usługi

Metylacja DNA to kluczowa modyfikacja epigenetyczna mająca wpływ na ekspresję genów, piętnowanie genomowe czy inaktywację chromosomu X. WGBS (Whole Genome Bisulfite Sequencing) to złoty standard w badaniach metylacji na poziomie pojedynczych nukleotydów. Oferujemy kompleksową usługę WGBS w oparciu o technologię DNBSEQ™, z kontrolą jakości i analizą bioinformatyczną.

1. Usługi

Zakres usługi

• Obróbka bisulfidowa i budowa biblioteki

• Sekwencjonowanie paired-end 100 bp

• Surowe dane + analiza standardowa lub dopasowana

• Możliwość przechowywania danych

• Czas realizacji: 26 dni roboczych (dostępny tryb przyspieszony)

• Zalecane pokrycie: ≥30X

Standardy jakości

• ≥90% czystych zasad o jakości Q20

• ≥99% współczynnik konwersji bisulfidowej

Rodzaje próbek

• gDNA, pełna krew, linie komórkowe, mrożone tkanki

• Regularne próbki: ≥0.5 µg, 12.5 ng/µL

• Niskie stężenie: ≥1 ng, 0.5 ng/µL

• Minimalna objętość: 15 µL

2. Etapy procesu

1. Kontrola jakości próbki

2. Obróbka bisulfidowa

3. Przygotowanie biblioteki

4. Sekwencjonowanie (DNBSEQ™)

5. Uzyskanie surowych danych

6. Analiza bioinformatyczna

3. Analiza bioinformatyczna

Standardowa analiza

• Filtrowanie danych

• Wyrównanie do genomu referencyjnego

• Analiza pokrycia i poziomu metylacji

• Identyfikacja globalnych trendów i różnicowo metylowanych regionów (DMR)

Analiza spersonalizowana

• Możliwość dostosowania zakresu analizy

• Wyniki w formatach: FASTQ, BAM, Excel

4. Technologia DNBSEQ™

Zastosowane technologie:

• Nanokulki DNA (DNB™)

• Rolling Circle Amplification

• Patterned Nano Arrays

• Technologia cPAS

Zalety:

• Niska duplikacja

• Wyjątkowa dokładność odczytów

• Wysoka przepustowość i przejrzystość danych

• Lepsze wykorzystanie danych w porównaniu do platform referencyjnych

• Mniejsze zakłócenia związane ze składem GC

5. Dla kogo?

• Jednostki prowadzące badania epigenetyczne

• Zespoły analizujące metylację w nowotworach i chorobach neurologicznych

• Instytuty naukowe i centra kliniczne

• Firmy biotechnologiczne i farmaceutyczne

6. Dlaczego warto?

• Kompleksowa usługa od próbki do wyniku

• Technologia DNBSEQ™ z wysoką efektywnością

• Wysoka jakość i precyzja danych

• Zespół specjalistów z doświadczeniem w analizach epigenetycznych

• Obsługa również niskiej ilości materiału wejściowego

Kontakt

Masz pytania lub chcesz uzyskać ofertę?
✉ gene@relvo.pl